Waalsでは、見たい部分を入れるための別の空間としてWorkspace（ワークスペース）が３つ用意されています。この空間に構造を選択して入れることにより、全体構造の中から部分的に取り出して表示することができます。 Workspaceに入っている構造の重心が回転中心になりますので、すぐに回転させながら細部を確認できます。構造を追加したり、取り除くこともで自由ですので、見たい部分だけを取り出すことができます。 Main-spaceと３つのWorkspaceは切替えて表示します。

指定するための選択は、アミノ酸配列からでも立体構造からでもできます。ドメインやモチーフなどの選択はContents Info Viewのアミノ酸配列からの選択が便利です（上）。Structure Viewからマウスで構造上の見たいところを選択することも可能です（下）。

立体構造から選択

選択した構造をWorkspaceに指定するには

1. 1.指定したい構造（アミノ酸残基やコンパウンド）をContents Info ViewやStructure Viewから選択します。
   

2. 2.メニューのWorkspace > Add into Workspace A, B, Cのいずれかを実行します。
   

3. 3.選択した構造が指定したWorkspaceに入ります。

Calmodulin (3CLN)（左）のEFハンド構造内のカルシウム結合部位20-31残基を

Workspaceに取り出した例（右）。

Workspace

Workspace

Workspaceに切替えて見るには

1. 1.Structure View下のスペース切替えボタンでWorkspaceの表示に切り替えます。
   

2. 2.それぞれのWorkspaceに指定した構造だけが表示されます。

Workspaceから構造を取り除くには

1. 1.取り除きたい構造をContents Info ViewやStructure Viewから選択します。
   

2. 2.メニューのWorkspace > Remove from Workspace A, B, Cのいずれかを実行します。
   

3. 3.選択した部分の構造が指定したWorkspaceから取り除かれます。

1. 二原子間の距離を測定する
   

2. 大きさを揃える
   

3. 数値を指定して向きを変更する
   

4. Bファクターで色分け表示にする
   

5. 表示の初期設定を変更する
   

6. 背景色と初期設定の変更
   

7. 背景色を透明にする

1. PDBファイルのサイト情報を表示する
   

2. 削除してPDBファイルに保存する
   

3. オートローテーションで見る
   

4. 新しいページに読み込む
   

5. 作成した図を複製して図を作る
   

6. 作図の基本の流れ
   

7. 二次構造をアサインする

アミノ酸配列から選択