チュートリアル

作成した図を複製して図を作る

  1. PDBファイルを開く

  1. PDBデータの内容を確認する

  1. 球ピックで距離で選択する

  1. Workspaceに指定する

  1. 部分的に色をつける

  1. チェイン単位で表示を設定する

  1. 特定の残基に表示形式を設定する

  1. 原子間の距離を測定する

  1. 大きさを揃える

  1. 数値を指定して向きを変える

  1. Bファクターで色分け表示する

  1. 表示の初期設定を変更する

  1. 背景色と初期設定を変更する

  1. 背景色を透明にする

  1. サイト情報を表示する

  1. 削除してPDBファイルに保存

  1. オートローテーションで見る

  1. 新しいページに読み込む

  1. 作成した図を複製して図を作る

図を作成した後で、向きや表示形式の一部を変えてもう一枚図を作りたい時に、最初から図を作る必要はありません。ページ機能を使えば、一度作成した図を利用してもう一枚の図を作ることができます。ページを複製すれば、設定した表示形式がそのままの状態で複製されます。あとは、向きや追加の設定など、変更を加えるだけです。

阻害剤のスタイルを変更

二次構造のスタイルと色を変更

Stick表示にして

Flexible loopを青に

一部を取り出してステレオ表示に

ページを複製するには

  1. 1.複製したいPageを表示します。

  2. 2.メニューのPage > Duplicate Pageを選択します。または⌘＋Dを押します。

  3. 3.選択した次のPageに複製されたPageが作成されます。

リボン表示の色をグレイに

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Triose-phosphate Isomerase (6TIM) の表示例

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Q & A

Waalsの特長

解析事例

  1. 作図する基本の流れ

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チュートリアル

  1. PDBファイルを開く

  2. PDBデータの内容を確認する

  3. 球ピックツールを使用して距離で選択する

  4. Workspaceに指定する

  5. 部分的に色をつける

  6. チェイン単位で表示形式を設定する

  7. 特定の残基に表示形式を設定する

  1. 二原子間の距離を測定する

  2. 大きさを揃える

  3. 数値を指定して向きを変更する

  4. Bファクターで色分け表示にする

  5. 表示の初期設定を変更する

  6. 背景色と初期設定の変更

  7. 背景色を透明にする

  1. PDBファイルのサイト情報を表示する

  2. 削除してPDBファイルに保存する

  3. オートローテーションで見る

  4. 新しいページに読み込む

  5. 作成した図を複製して図を作る

  6. 作図の基本の流れ

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  1. 二次構造をアサインする