複数ファイルを同一画面に表示する

複数の立体構造を併置したり、重ね合わせや構造比較を行う場合には、一つのページに複数のPDBデータを読み込みます。

Structure Viewは画面を分割／切替えて表示することができます。

Contents Info Viewでは、ファイルごとに切替えて表示します。

画面の分割と切替え表示

Waalsでは、PDBデータを複数の画面に分割して表示したり、PDBデータを１つずつ切り替えて表示することができます。

複数の構造を併置して比較する場合は、画面を分割して表示すると便利です。それぞれの構造を中心に、一緒に回転させて見ることができます。

切替え表示は、ファイル毎に切替えて見ることができます。重ね合わせた結果を見る場合にも便利です。

切替え表示

分割表示

回転

画面の分割は４分割まで

画面の分割は４分割まで可能です。 画面の分割数（１〜４）、どのPDBデータをどのエリアに表示するかの指定、PDBデータごとの表示／非表示の設定ができます。

分割した状態で、Compound Interface等の解析機能や、ツールアイコン、Workspaceを使用することができます。複数の構造を使って、阻害様式の比較などを行う時に便利です。

複数のPDBファイルを同一書類の複数ページで

一つの書類に複数のPDBファイルを読み込んで、それぞれのPDBデータを個別に、ページごとに表示することができます。解析に必要な一連のファイルを読み込み、同一書類で作図、解析ができます。複数のPDBファイルを表示しながら解析を進めたい時に便利です。

トリプシンファミリーのPDBファイル４種を同一書類に読み込んだ例。Page1〜4にそれぞれ表示されます。

左からTrypsinogen and its Complexes with Inhibitors(2PTC), Trypsin(3M35), Chymotrypsin (6CHA), Elastase (7EST)。

Waalsの特長

もっと便利に

1. ページ機能
   

2. ライブラリ機能
   

3. 複数のPDBファイルを使う
   

保存する

1. Copy & PasteでFigureを作成
   

2. Waals書類でそのまま保存する
   

3. 図のイメージや立体構造座標を保存する
   

動画を作成する

1. 動画を作成する
   

2. 作成した動画

作図する

1. 基本の表示形式を設定する
   

2. 部分的にスタイルを設定する
   

3. 立体構造の向きや大きさをそろえる
   

分子間の距離関係を調べる

1. タンパク質と結合物との距離関係を調べる
   

2. チェイン間の距離関係を調べる
   

重ね合わせと比較

1. 立体構造を重ね合わせる
   

2. 立体構造を比較する
   

3. 重ね合わせ・比較機能を使って

Ras protein (5P21)にRan and Ran binding domain complex (1RRP)のChain AをAuto-Fitで重ね合わせた結果を表示しています。