向きを保存する

自分の好きな向きを覚えておきたい時には、「向きの保存」が便利です。構造を回転させて見ながら良い向きがあったら、表示している現在の向きを保存。その後、向きを変えても保存した向きに戻すことができます。

チュートリアル「数値を指定して向きを変更する」▶

数値を指定して向きを変更する

X軸方向やY軸方向に90度など、数値を指定して向きを変更することもできます。論文のFigure等で、複数の向きの図を併置する際に便利です。

同じ向きの図を作る、向きを揃える

Page機能を使って、ページをリンクすれば、書類内の複数の図を一括して同じ向きに揃えることもできます。リンク元の図を回転すると、リンクされた他の図も同じ向きに揃います。

「ページ機能」について詳しく　▶

初期の向きを変更する

見たい向きが決まっている場合は、PDBデータの初期の向きを変更すると便利です。ライブラリ機能を使って初期の向きを好きな向きに変更できます。読み込んだ時点で、変更した向きで表示されます。

「ライブラリ機能」について詳しく　▶

大きさを揃える

作図の際には、同じ向き、同じ大きさの図を複数作成することが多くあります。２つの図を同じ大きさに揃えたいときは、スケール値を同じ値に合わせます。スケール値は、マウスによる拡大縮小しながら、また、数値を指定しても指定できます。同一ファイルから作成した複数の図はもちろん、異なるPDBファイルの構造もスケール値を揃えることにより、同じスケールで表示することができます。構造を併置するFigureを作成する場合に便利です。

G proteinファミリーの３つのファイル、Ras protein (5P21)（左）、Gi alpha 3 and RGS10 complex (2IHB)（中央）、

Ran and Ran binding domain complex (1RRP)（右）を同一のスケールで表示。Auto-Fitにより向きを揃えています。

同一タンパク質やファミリータンパク質で、異なるPDBファイルの向きを揃えたい場合は、重ね合わせを行います。

「重ね合わせ・比較機能を使って」を見る　▶

左から、トリプシンとトリプシンインヒビター複合体(2PTC)、キモトリプシン(6CHA)、エラスターゼ(6EST)の

３つのファイルを同一のスケールで表示しています。

Waalsの特長

K Channel (1BL8)のSideから見た図（左の列）とBottomから見た図（右の列）。左の列４枚及び右の列４枚はそれぞれ向きを揃えています。

もっと便利に

1. ページ機能
   

2. ライブラリ機能
   

3. 複数のPDBファイルを使う
   

保存する

1. Copy & PasteでFigureを作成
   

2. Waals書類でそのまま保存する
   

3. 図のイメージや立体構造座標を保存する
   

動画を作成する

1. 動画を作成する
   

2. 作成した動画

作図する

1. 基本の表示形式を設定する
   

2. 部分的にスタイルを設定する
   

3. 立体構造の向きや大きさをそろえる
   

分子間の距離関係を調べる

1. タンパク質と結合物との距離関係を調べる
   

2. チェイン間の距離関係を調べる
   

重ね合わせと比較

1. 立体構造を重ね合わせる
   

2. 立体構造を比較する
   

3. 重ね合わせ・比較機能を使って