1. •新しいPDBファイルを別のウインドウで開くには？
   

Waals書類が開いている状態でFile > Open...によりPDBファイルを開くと、現在開かれているウインドウの新しいPageでファイルが開かれます。新たに別ウインドウでファイルを開きたい場合は、メニューのFile > Newで新しいウインドウを作成し、File > Open...でPDBファイルを開きます。

1. •同じPDBデータで別の図を作りたいときには？
   

一度開いたPDBファイルと同じPDBデータを使用する場合は、新たにPDBファイルを開くのではなく、ライブラリから読み込みます。

メニューのPage > New Pageで新しいPageを作り、Insert from Library... を選択します。

また、Pageを複製すれば、その状態から編集することができます。

Waals ユーザーガイド第１３章の「ライブラリに登録されたPDBデータを読み込む」をご参照下さい。

1. •複数のPDBファイルを一度に選択するには？
   

ファイルのOpen... 及びInsert... では、PDBファイルを複数選択することができます。

連続したデータを選択する場合は、ダイアログからシフトキーを押したままファイルを選択します。

⌘キーを押して、クリックすると選択／解除をしながら複数のファイルを選択できます。

ライブラリのPDBデータを選択する際にも、同様の操作ができます。

1. •複数のアミノ酸残基を一度に選択するには？
   

Contents Info Viewで、複数のアミノ酸残基を選択するには以下の方法があります。

連続したアミノ酸残基を選択するには：

　アミノ酸配列上でマウスをドラッグして選択します。

　または、選択したい部分のN末端のアミノ酸残基をクリックしてから、Shiftキーを押し、C末端のアミノ酸残基をクリックすると、

　その間のアミノ酸残基全てが選択されます。

不連続なアミノ酸残基を複数選択するには；

　予め、Shiftキーを押した状態で、選択したい複数のアミノ酸残基をクリックします。

１つのChainのアミノ酸残基全てを選択するには：

　ContentsリストのChain名をダブルクリックすると、そのChainのアミノ酸残基全てを選択することができます。

　または、Contents Info Viewにマウスを入れた状態で、⌘+Aキーを押すと詳細表示エリアに現在表示されているアミノ酸残基が全て選択されます。

1. •何度も使用するアミノ酸残基を登録することはできますか？
   

サイト機能で、アミノ酸残基のセットとサイトIDを登録することができます。例えば、「基質結合に関与するアミノ酸残基５つを一つのIDで登録することができます。そのセットをまとめて表示形式を変更したり、選択したりすることができます。

詳細は、Waals ユーザーガイド第１４章の「サイト機能を使う」をご参照下さい。

1. •チェインごとに水分子を選択することはできますか？
   

Contents Info Viewでは、各水分子に水和しているチェインのIDが表示されます。

Contents Info Viewの項目表示エリアでWaterを選択します。PDBに記載されている各HOHに水和しているチェインのIDが表示されますので、参考にして選択します。

各チェインのアミノ酸残基を削除したり隠したりする場合に、そのチェインに水和している水分子を選択する場合に参考にして下さい。

1. •二次構造情報をPDBフォーマットに書き出すことはできますか？
   

PDBフォーマットで保存すると、二次構造情報もPDBファイルに書き出します。

二次構造情報がない場合は、予め二次構造のアサインを行います。その後、メニューのFile > Save as PDB formatを選択します。

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