共通構造の抽出結果を動画にする

共通構造の抽出結果は、スライドショームービーにすると、重なり方や共通な部分をわかりやすく示すことができます。

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Waalsで作成した動画（ムービー）の例 3　　　動画は全てQuickTime Movieです。

コンフォメーション変化を動画にする

コンフォメーションの異なる２つの立体構造を重ね合わせた結果は、動画で示すと効果的です。

NMRデータのMODELを動画にする

Calmodulin （Nドメイン）のNMRデータ(1F55)の30モデルを動画にしています。

Waalsの特長

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タンパク質分子のためのインタフェース

  1. 立体構造とアミノ酸配列を表示する２つのView

  2. 立体構造から調べる「ツールアイコン」

見る・調べる

  1. 立体構造を隠す・削除する

  2. フォーカスして調べる「ワークスペース機能」

  3. 近傍のアミノ酸残基を検出する「球ピック機能」

  4. 距離を測定する


もっと便利に

  1. ページ機能

  2. ライブラリ機能

  3. 複数のPDBファイルを使う

保存する

  1. Copy & PasteでFigureを作成

  2. Waals書類でそのまま保存する

  3. 図のイメージや立体構造座標を保存する

動画を作成する

  1. 動画を作成する

  2. 作成した動画

作図する

  1. 基本の表示形式を設定する

  2. 部分的にスタイルを設定する

  3. 立体構造の向きや大きさをそろえる

分子間の距離関係を調べる

  1. タンパク質と結合物との距離関係を調べる

  2. チェイン間の距離関係を調べる

重ね合わせと比較

  1. 立体構造を重ね合わせる

  2. 立体構造を比較する

  3. 重ね合わせ・比較機能を使って

PDBファイルを入手する

Q & A

チュートリアル

表示・解析例

  1. 立体構造とアミノ酸配列の表示

蛋白質のためのインタフェース

Waalsの特長

  1. 立体構造から調べる

見る・調べる

  1. 立体構造を隠す・削除する

  1. 部分的に取り出す

  1. 近傍のアミノ酸残基を検出する

  1. 距離を測定する

作図する

分子間の距離関係を調べる

  1. 基本の表示形式を設定する

  1. 部分的にスタイルを設定する

  1. 向きや大きさをそろえる

重ね合わせと比較

  1. 結合物との距離関係を調べる

  1. チェイン間の距離関係を調べる

  1. 立体構造を重ね合わせる

  1. 立体構造を比較する

  1. 重ね合わせ・比較機能を使って

もっと便利に

  1. ページ機能

  1. ライブラリ機能

  1. 複数のPDBファイルを使う

保存する

  1. Copy & PasteでFigureを作成

  1. Waals書類でそのまま保存する

  1. イメージや座標を保存する

  1. 動画を作成する

動画を作成する

  1. 作成した動画

チュートリアル

PDBファイルを入手する

Q & A

解析事例

解析事例「コンフォメーション変化を見る」　▶

Pageから作成した動画（スライドショームービー）の例

Waalsの特長 INDEX

多量体の様子を動画にする

立体構造を比較する　▶

◀ 揺れ（Rocking Motion）の動画の例を見る

回転（Rotation）の動画の例を見る ▶