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基本の表示形式を設定する

美しい図を簡単に。

Waalsなら図を作成するのも楽しくなります。基本の表示はパネルで色やスタイルを選択するだけだから、様々な表示スタイルを試しながら、見やすい表示スタイルを見つけられます。

基本表示のスタイル例

チュートリアル 「基本表示の初期設定を変更する」▶

初期表示のスタイルを設定

初期表示は好きな表示形式に設定できます。PDBファイルを開いた時点で設定した表示形式で表示されます。見たい表示形式が決まっている場合に便利です。

Waalsの特長

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タンパク質分子のためのインタフェース

  1. 立体構造とアミノ酸配列を表示する２つのView

  2. 立体構造から調べる「ツールアイコン」

見る・調べる

  1. 立体構造を隠す・削除する

  2. フォーカスして調べる「ワークスペース機能」

  3. 近傍のアミノ酸残基を検出する「球ピック機能」

  4. 距離を測定する


もっと便利に

  1. ページ機能

  2. ライブラリ機能

  3. 複数のPDBファイルを使う

保存する

  1. Copy & PasteでFigureを作成

  2. Waals書類でそのまま保存する

  3. 図のイメージや立体構造座標を保存する

動画を作成する

  1. 動画を作成する

  2. 作成した動画

作図する

  1. 基本の表示形式を設定する

  2. 部分的にスタイルを設定する

  3. 立体構造の向きや大きさをそろえる

分子間の距離関係を調べる

  1. タンパク質と結合物との距離関係を調べる

  2. チェイン間の距離関係を調べる

重ね合わせと比較

  1. 立体構造を重ね合わせる

  2. 立体構造を比較する

  3. 重ね合わせ・比較機能を使って

PDBファイルを入手する

Q & A

チュートリアル

表示・解析例

  1. 立体構造とアミノ酸配列の表示

蛋白質のためのインタフェース

Waalsの特長

  1. 立体構造から調べる

見る・調べる

  1. 立体構造を隠す・削除する

  1. 部分的に取り出す

  1. 近傍のアミノ酸残基を検出する

  1. 距離を測定する

作図する

分子間の距離関係を調べる

  1. 基本の表示形式を設定する

  1. 部分的にスタイルを設定する

  1. 向きや大きさをそろえる

重ね合わせと比較

  1. 結合物との距離関係を調べる

  1. チェイン間の距離関係を調べる

  1. 立体構造を重ね合わせる

  1. 立体構造を比較する

  1. 重ね合わせ・比較機能を使って

もっと便利に

  1. ページ機能

  1. ライブラリ機能

  1. 複数のPDBファイルを使う

保存する

  1. Copy & PasteでFigureを作成

  1. Waals書類でそのまま保存する

  1. イメージや座標を保存する

  1. 動画を作成する

動画を作成する

  1. 作成した動画

チュートリアル

PDBファイルを入手する

Q & A

解析事例

基本表示はパネルで選択

立体構造の基本の表示形式はパネルから選択します。
二次構造の表示を設定するCartoonsとアミノ酸残基の表示を設定するResiduesと、結合物を表示するCompoundsに分かれており、それぞれの項目から、スタイルや色、表示/非表示を選びます。

DNAもRNAも美しく

Waals 2013では、タンパク質とは別に、DNAとRNAのためのリボン表示とチューブ表示をつくりました。DNAの二重螺旋構造をリボンやチューブで、美しく、わかりやすく表示できます。

Waalsの特長 INDEX